transparent huge page (khugepaged) の競合

Issue

• MPI ジョブは通常 256 プロセス (ホストあたり 16 プロセス) を実行しますが、使用可能な RAM をすべて消費するわけではありません。
• ジョブは数日間実行されますが、最初の 24 時間後には、ユーザーは遅延が発生することに気付きます。
• ホストログファイルには、メモリーアクセス中にプロセスが長時間ブロックされていたことが示されていました。
• 時々、"khugepaged" もブロックしていることが確認できました。

2013-03-28 22:32:25 INFO: task khugepaged:357 blocked for more than 120 seconds.
2013-03-28 22:32:25 "echo 0 > /proc/sys/kernel/hung_task_timeout_secs" disables this message.
2013-03-28 22:32:25 khugepaged    D 000000000000000a     0   357      2 0x00000000
2013-03-28 22:32:25  ffff88083169fc90 0000000000000046 0000000000000003 ffff880840021b40
2013-03-28 22:32:25  ffff880831696080Mar 28 22:32:25  00000000004352dabullet0179 kerne ffff88083169fd40l: INFO: task kh ffffffff8112c02bugepaged:357 blo
2013-03-28 22:32:25 cked for more th ffff880831696638an 120 seconds.
2013-03-28 22:32:25  ffff88083169ffd8Mar 28 22:32:25  000000000000fb88bullet0179 kerne ffff880831696638l: "echo 0 > /pr
2013-03-28 22:32:25 oc/sys/kernel/huCall Trace:
2013-03-28 22:32:25 ng_task_timeout_ [<ffffffff8112c02b>] ? __alloc_pages_nodemask+0x57b/0x8d0
2013-03-28 22:32:25 secs" disables t [<ffffffff8150fd25>] rwsem_down_failed_common+0x95/0x1d0
2013-03-28 22:32:25 his message.
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff8150fe83>] rwsem_down_write_failed+0x23/0x30
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff812834c3>] call_rwsem_down_write_failed+0x13/0x20
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff8150f382>] ? down_write+0x32/0x40
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff81179f96>] khugepaged+0x7f6/0x1310
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff81096ca0>] ? autoremove_wake_function+0x0/0x40
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff811797a0>] ? khugepaged+0x0/0x1310
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff81096936>] kthread+0x96/0xa0
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff8100c0ca>] child_rip+0xa/0x20
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff810968a0>] ? kthread+0x0/0xa0
2013-03-28 22:32:25  [<ffffffff8100c0c0>] ? child_rip+0x0/0x20
2013-03-28 22:32:25 Kernel panic - not syncing: hung_task: blocked tasks