Error org.jboss.modules.ModuleLoadException on JBoss EAP 6

Issue

• Stack trace starting JBoss EAP:

        Exception in thread "main" org.jboss.modules.ModuleLoadException: Error loading module from /jboss-eap-6.4/modules/system/layers/base/org/jboss/vfs/main/module.xml
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleXml(ModuleXmlParser.java:154)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleXml(ModuleXmlParser.java:131)
        at org.jboss.modules.LocalModuleFinder$1.run(LocalModuleFinder.java:154)
        at org.jboss.modules.LocalModuleFinder$1.run(LocalModuleFinder.java:148)
        at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
        at org.jboss.modules.LocalModuleFinder.findModule(LocalModuleFinder.java:148)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.findModule(ModuleLoader.java:456)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.loadModuleLocal(ModuleLoader.java:359)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.preloadModule(ModuleLoader.java:306)
        at org.jboss.modules.Module.addPaths(Module.java:1036)
        at org.jboss.modules.Module.link(Module.java:1406)
        at org.jboss.modules.Module.relinkIfNecessary(Module.java:1434)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.loadModule(ModuleLoader.java:242)
        at org.jboss.modules.Main.main(Main.java:387)
        Caused by: org.jboss.modules.xml.XmlPullParserException: Failed to add resource root 'jboss-vfs-3.2.9.Final-redhat-1.jar' at path 'jboss-vfs-3.2.9.Final-redhat-1.jar' (position: END_TAG seen ...        <resource-root path="jboss-vfs-3.2.9.Final-redhat-1.jar"/>... @32:67) caused by: java.util.zip.ZipException: error in opening zip file
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseResourceRoot(ModuleXmlParser.java:797)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseResources(ModuleXmlParser.java:643)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleContents(ModuleXmlParser.java:445)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseDocument(ModuleXmlParser.java:264)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleXml(ModuleXmlParser.java:152)
        ... 13 more

• Normal users are unable to launch jboss-cli.sh

Exception in thread "main" org.jboss.modules.ModuleLoadException: Error loading module from /opt/jboss-eap-6.4-master/modules/system/layers/base/org/jboss/as/cli/main/module.xml
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleXml(ModuleXmlParser.java:154)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleXml(ModuleXmlParser.java:131)
        at org.jboss.modules.LocalModuleFinder$1.run(LocalModuleFinder.java:154)
        at org.jboss.modules.LocalModuleFinder$1.run(LocalModuleFinder.java:148)
        at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
        at org.jboss.modules.LocalModuleFinder.findModule(LocalModuleFinder.java:148)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.findModule(ModuleLoader.java:515)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.loadModuleLocal(ModuleLoader.java:360)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.preloadModule(ModuleLoader.java:307)
        at org.jboss.modules.ModuleLoader.loadModule(ModuleLoader.java:239)
        at org.jboss.modules.Main.main(Main.java:387)
Caused by: org.jboss.modules.xml.XmlPullParserException: Failed to add resource root 'jboss-as-cli-7.5.0.Final-redhat-21.jar' at path 'jboss-as-cli-7.5.0.Final-redhat-21.jar' (position: END_TAG seen ...    <resource-root path="jboss-as-cli-7.5.0.Final-redhat-21.jar"/>... @33:71) caused by: java.util.zip.ZipException: error in opening zip file
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseResourceRoot(ModuleXmlParser.java:797)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseResources(ModuleXmlParser.java:643)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleContents(ModuleXmlParser.java:445)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseDocument(ModuleXmlParser.java:264)
        at org.jboss.modules.ModuleXmlParser.parseModuleXml(ModuleXmlParser.java:152)
        ... 10 more